Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf8Q6DID3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scaf8Q6DID3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms