Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop58Q6DFW4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop58Q6DFW4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms