Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pram1Q6BCL1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pram1Q6BCL1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms