Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp7Q6A4J8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp7Q6A4J8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp7Q6A4J8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp7Q6A4J8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp7Q6A4J8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp7Q6A4J8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp7Q6A4J8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Usp7Q6A4J8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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