Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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