Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift52Q62559 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms