Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sall3Q62255 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall3Q62255 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms