Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six2Q62232 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms