Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sin3bQ62141 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sin3bQ62141 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms