Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxj1Q61660 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms