Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp7Q60973 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms