Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atf3Q60765 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atf3Q60765 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms