Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nr2f1Q60632 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms