Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Trim38Q5SZ99 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Trim38Q5SZ99 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Trim38Q5SZ99 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Trim38Q5SZ99 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Trim38Q5SZ99 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Trim38Q5SZ99 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Trim38Q5SZ99 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Trim38Q5SZ99 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Trim38Q5SZ99 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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