Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psme4Q5SSW2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms