Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms