Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Trappc1Q5NCF2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Trappc1Q5NCF2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms