Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Spata48Q5NC83 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Spata48Q5NC83 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata48Q5NC83 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms