Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nlrc3Q5DU56 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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