Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp22Q5DU02 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp22Q5DU02 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp22Q5DU02 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp22Q5DU02 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp22Q5DU02 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp22Q5DU02 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp22Q5DU02 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp22Q5DU02 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp22Q5DU02 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Usp22Q5DU02 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Usp22Q5DU02 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Usp22Q5DU02 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp22Q5DU02 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms