Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chsy3Q5DTK1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chsy3Q5DTK1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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