Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri2Q5BKS4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms