Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shank3Q4ACU6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms