Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Fam220aQ3ZN08 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Fam220aQ3ZN08 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Fam220aQ3ZN08 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Fam220aQ3ZN08 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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