Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ankrd53Q3V0J4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms