Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms