Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capn13Q3UW68 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn13Q3UW68 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms