Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TceancQ3US16 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms