Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atxn7l3bQ3UD01 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Atxn7l3bQ3UD01 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms