Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms