Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
VwceQ3U515 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VwceQ3U515 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms