Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Fam117bQ3U3E2 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Fam117bQ3U3E2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Fam117bQ3U3E2 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Fam117bQ3U3E2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Fam117bQ3U3E2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam117bQ3U3E2 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Fam117bQ3U3E2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Fam117bQ3U3E2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Fam117bQ3U3E2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam117bQ3U3E2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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