Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc13Q3TIR1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms