Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec11Q3SXB8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec11Q3SXB8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms