Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

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Length 1,197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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Zbtb38Q3LR78 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb38Q3LR78 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Zbtb38Q3LR78 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb38Q3LR78 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb38Q3LR78 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb38Q3LR78 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb38Q3LR78 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb38Q3LR78 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb38Q3LR78 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb38Q3LR78 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms