Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hdgfl1Q2VPR5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl1Q2VPR5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms