Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm1Q2TV84 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm1Q2TV84 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms