Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrna5Q2MKA5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms