Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd12Q0VE29 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd12Q0VE29 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms