Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rundc1Q0VDN7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms