Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc21bQ0HA38 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc21bQ0HA38 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms