Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a2Q07643 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a2Q07643 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms