Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp2Q06649 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bp2Q06649 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 356.7 ms