Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Thbs3Q05895 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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