Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smpd1Q04519 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd1Q04519 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms