Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl7Q03366 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms