Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlh1Q02576 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nhlh1Q02576 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms