Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ascl1Q02067 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ascl1Q02067 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms