Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxd1Q01822 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms