Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2aQ01320 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Top2aQ01320 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top2aQ01320 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms